Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms