Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms