Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms