Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms