Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms