Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms