Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPP4R4Q6NUP7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms