Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms