Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms