Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF13Q15543 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF13Q15543 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF13Q15543 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF13Q15543 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF13Q15543 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF13Q15543 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF13Q15543 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF13Q15543 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF13Q15543 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF13Q15543 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF13Q15543 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF13Q15543 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF13Q15543 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF13Q15543 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF13Q15543 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF13Q15543 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF13Q15543 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF13Q15543 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF13Q15543 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF13Q15543 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF13Q15543 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF13Q15543 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF13Q15543 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF13Q15543 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF13Q15543 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF13Q15543 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF13Q15543 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF13Q15543 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF13Q15543 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF13Q15543 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF13Q15543 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF13Q15543 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF13Q15543 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF13Q15543 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF13Q15543 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF13Q15543 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF13Q15543 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF13Q15543 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF13Q15543 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF13Q15543 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF13Q15543 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF13Q15543 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF13Q15543 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF13Q15543 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF13Q15543 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF13Q15543 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms