Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 POLRMT-208ENST00000592863 966 ntTSL 518.14■□□□□ 0.493e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PGAP2-222ENST00000487112 792 ntTSL 318.09■□□□□ 0.493e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.483e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 GPAA1-217ENST00000532758 1079 ntTSL 318.06■□□□□ 0.483e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 LINC01089-201ENST00000428029 1024 ntTSL 218.06■□□□□ 0.483e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 GPAA1-204ENST00000525087 937 ntTSL 518.06■□□□□ 0.483e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.473e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.473e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 GPAA1-214ENST00000530633 835 ntTSL 317.94■□□□□ 0.463e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.463e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 OSBPL10-205ENST00000452791 485 ntTSL 317.89■□□□□ 0.453e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.443e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.433e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.433e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.433e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.423e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.413e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PRKCZ-218ENST00000482686 614 ntTSL 317.44■□□□□ 0.383e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.383e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.365e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PRMT1-216ENST00000530361 866 ntTSL 317.19■□□□□ 0.343e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 GPAA1-205ENST00000525308 903 ntTSL 217.17■□□□□ 0.343e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.343e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 KLHDC4-217ENST00000566661 2232 ntTSL 517.14■□□□□ 0.333e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 CMIP-205ENST00000564666 510 ntTSL 317.13■□□□□ 0.333e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 KLHDC4-202ENST00000316853 1287 ntTSL 1 (best)17.11■□□□□ 0.333e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.333e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.324e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 POGLUT1-207ENST00000486607 1420 ntTSL 217.01■□□□□ 0.313e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 HYOU1-215ENST00000543287 2464 ntTSL 216.99■□□□□ 0.313e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 ISG20-209ENST00000560573 2698 ntTSL 1 (best)16.96■□□□□ 0.313e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 SLC25A36-214ENST00000515813 738 ntTSL 216.88■□□□□ 0.295e-8■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 ZNF148-208ENST00000495019 763 ntTSL 516.83■□□□□ 0.283e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 ABCA2-207ENST00000437791 697 ntTSL 516.75■□□□□ 0.273e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 KLHDC4-215ENST00000566349 1377 ntTSL 216.74■□□□□ 0.273e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 KCTD15-205ENST00000588637 571 ntTSL 516.7■□□□□ 0.263e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 AP2A1-205ENST00000597774 2196 ntTSL 516.58■□□□□ 0.256e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 HYOU1-205ENST00000529174 549 ntTSL 416.52■□□□□ 0.243e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 NTHL1-207ENST00000566380 814 ntTSL 316.47■□□□□ 0.233e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.223e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 CTSA-207ENST00000484855 2183 ntTSL 1 (best)16.43■□□□□ 0.223e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 SLC25A36-205ENST00000502594 1163 ntTSL 1 (best)16.34■□□□□ 0.215e-8■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 ISG20-206ENST00000558942 2644 ntTSL 516.27■□□□□ 0.23e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PCGF3-209ENST00000475288 604 ntTSL 316.26■□□□□ 0.193e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 C14orf80-213ENST00000455454 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 516.25■□□□□ 0.193e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.193e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PCBP4-214ENST00000490063 510 ntTSL 516.13■□□□□ 0.173e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.163e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.163e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.153e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 C14orf80-207ENST00000421892 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 315.99■□□□□ 0.153e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 LINC01089-210ENST00000543167 1059 ntTSL 215.98■□□□□ 0.153e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.143e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 RBM33-210ENST00000486747 559 ntTSL 315.88■□□□□ 0.133e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.133e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.123e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.113e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 JMJD7-204ENST00000431823 828 ntTSL 515.74■□□□□ 0.113e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 RHOF-206ENST00000545544 826 ntTSL 515.73■□□□□ 0.113e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 POGLUT1-208ENST00000497447 1361 ntTSL 215.72■□□□□ 0.113e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.15e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.13e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 RHOF-205ENST00000541657 1626 ntTSL 515.64■□□□□ 0.093e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 ISG20-208ENST00000559876 614 ntTSL 315.56■□□□□ 0.083e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 CTSA-214ENST00000606788 3056 ntTSL 215.55■□□□□ 0.083e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 C14orf80-220ENST00000551538 4437 ntTSL 215.54■□□□□ 0.083e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 NTHL1-209ENST00000568513 837 ntTSL 315.53■□□□□ 0.083e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 NTHL1-204ENST00000562120 501 ntTSL 215.53■□□□□ 0.083e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 RIC8A-216ENST00000532373 620 ntTSL 315.51■□□□□ 0.075e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 POLR3E-217ENST00000569757 662 ntTSL 415.49■□□□□ 0.072e-11■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.063e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 RAP1A-203ENST00000433097 666 ntTSL 515.45■□□□□ 0.063e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.053e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 DDR1-231ENST00000417521 1479 ntTSL 515.38■□□□□ 0.053e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PGAP2-221ENST00000485602 832 ntTSL 515.36■□□□□ 0.053e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.053e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.053e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.033e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.035e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.033e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 BTF3-206ENST00000510787 610 ntTSL 215.2■□□□□ 0.023e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 HYOU1-222ENST00000622474 549 ntTSL 215.18■□□□□ 0.023e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.023e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.025e-8■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 05e-8■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -03e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 NDUFB2-211ENST00000476181 660 ntTSL 1 (best)15□□□□□ -0.013e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 GPAA1-203ENST00000524418 825 ntTSL 314.91□□□□□ -0.023e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.023e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 GNA11-203ENST00000586763 354 ntTSL 314.89□□□□□ -0.033e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 NDUFB2-205ENST00000464564 469 ntTSL 514.82□□□□□ -0.043e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PCBP4-217ENST00000497653 559 ntTSL 414.8□□□□□ -0.043e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 KCTD15-203ENST00000587559 622 ntTSL 414.8□□□□□ -0.043e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 DDR1-244ENST00000482873 2673 ntTSL 514.79□□□□□ -0.043e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.043e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 JMJD7-PLA2G4B-203ENST00000476036 577 ntTSL 514.78□□□□□ -0.043e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 SLC13A5-212ENST00000576323 574 ntTSL 414.76□□□□□ -0.053e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.063e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.063e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PGAP2-218ENST00000478773 917 ntTSL 314.67□□□□□ -0.063e-6■■■■□ 25.7
Retrieved 100 of 29,421 protein–RNA pairs in 150.4 ms