Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RFTN1Q14699 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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