Protein–RNA interactions for Protein: Q14690

PDCD11, Protein RRP5 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD11Q14690 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
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