Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ERV3-1Q14264 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms