Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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