Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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UBE4AQ14139 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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UBE4AQ14139 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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UBE4AQ14139 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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UBE4AQ14139 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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UBE4AQ14139 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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UBE4AQ14139 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBE4AQ14139 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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