Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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