Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms