Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms