Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms