Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms