Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms