Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF3P57682 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF3P57682 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF3P57682 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF3P57682 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF3P57682 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF3P57682 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF3P57682 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF3P57682 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF3P57682 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF3P57682 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF3P57682 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF3P57682 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF3P57682 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF3P57682 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF3P57682 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF3P57682 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF3P57682 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF3P57682 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF3P57682 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF3P57682 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF3P57682 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF3P57682 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF3P57682 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF3P57682 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF3P57682 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF3P57682 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF3P57682 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF3P57682 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF3P57682 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF3P57682 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF3P57682 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF3P57682 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF3P57682 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF3P57682 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF3P57682 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF3P57682 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF3P57682 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF3P57682 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF3P57682 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF3P57682 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF3P57682 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF3P57682 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF3P57682 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF3P57682 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF3P57682 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLF3P57682 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLF3P57682 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLF3P57682 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLF3P57682 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLF3P57682 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLF3P57682 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLF3P57682 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLF3P57682 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLF3P57682 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLF3P57682 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLF3P57682 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLF3P57682 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLF3P57682 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLF3P57682 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF3P57682 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF3P57682 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF3P57682 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF3P57682 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF3P57682 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF3P57682 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF3P57682 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF3P57682 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF3P57682 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF3P57682 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF3P57682 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF3P57682 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF3P57682 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF3P57682 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF3P57682 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF3P57682 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF3P57682 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF3P57682 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF3P57682 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF3P57682 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF3P57682 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF3P57682 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF3P57682 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF3P57682 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF3P57682 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF3P57682 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF3P57682 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF3P57682 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF3P57682 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF3P57682 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF3P57682 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF3P57682 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF3P57682 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF3P57682 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF3P57682 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF3P57682 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF3P57682 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF3P57682 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF3P57682 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF3P57682 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms