Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF135P52742 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF135P52742 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF135P52742 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF135P52742 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF135P52742 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF135P52742 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF135P52742 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF135P52742 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF135P52742 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF135P52742 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF135P52742 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF135P52742 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF135P52742 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF135P52742 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF135P52742 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF135P52742 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF135P52742 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF135P52742 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF135P52742 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF135P52742 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF135P52742 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF135P52742 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF135P52742 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF135P52742 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF135P52742 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF135P52742 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF135P52742 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF135P52742 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms