Protein–RNA interactions for Protein: P50553

ASCL1, Achaete-scute homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL1P50553 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL1P50553 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL1P50553 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL1P50553 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL1P50553 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL1P50553 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL1P50553 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL1P50553 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL1P50553 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL1P50553 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL1P50553 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL1P50553 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL1P50553 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL1P50553 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL1P50553 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL1P50553 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL1P50553 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL1P50553 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASCL1P50553 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ASCL1P50553 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASCL1P50553 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASCL1P50553 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASCL1P50553 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASCL1P50553 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASCL1P50553 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASCL1P50553 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASCL1P50553 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASCL1P50553 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASCL1P50553 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASCL1P50553 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL1P50553 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms