Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms