Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms