Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms