Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

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Length 1,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL4A5P29400 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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