Protein–RNA interactions for Protein: P27708

CAD, CAD protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADP27708 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CADP27708 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CADP27708 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CADP27708 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CADP27708 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CADP27708 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CADP27708 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CADP27708 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CADP27708 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CADP27708 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CADP27708 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CADP27708 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CADP27708 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CADP27708 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CADP27708 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CADP27708 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CADP27708 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CADP27708 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CADP27708 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CADP27708 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CADP27708 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CADP27708 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CADP27708 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CADP27708 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CADP27708 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CADP27708 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CADP27708 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CADP27708 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CADP27708 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CADP27708 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CADP27708 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CADP27708 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CADP27708 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CADP27708 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CADP27708 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CADP27708 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CADP27708 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CADP27708 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CADP27708 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CADP27708 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CADP27708 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CADP27708 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CADP27708 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CADP27708 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CADP27708 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CADP27708 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CADP27708 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CADP27708 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CADP27708 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CADP27708 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CADP27708 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CADP27708 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CADP27708 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CADP27708 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CADP27708 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CADP27708 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CADP27708 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CADP27708 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CADP27708 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CADP27708 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CADP27708 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CADP27708 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CADP27708 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CADP27708 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CADP27708 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CADP27708 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CADP27708 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CADP27708 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CADP27708 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CADP27708 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CADP27708 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CADP27708 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CADP27708 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CADP27708 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CADP27708 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CADP27708 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CADP27708 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CADP27708 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CADP27708 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CADP27708 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CADP27708 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CADP27708 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CADP27708 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CADP27708 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CADP27708 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CADP27708 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CADP27708 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CADP27708 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CADP27708 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CADP27708 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CADP27708 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CADP27708 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CADP27708 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CADP27708 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CADP27708 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CADP27708 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CADP27708 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CADP27708 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CADP27708 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CADP27708 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 207.4 ms