Protein–RNA interactions for Protein: P21757

MSR1, Macrophage scavenger receptor types I and II, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSR1P21757 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSR1P21757 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSR1P21757 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSR1P21757 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSR1P21757 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSR1P21757 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSR1P21757 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSR1P21757 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSR1P21757 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSR1P21757 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSR1P21757 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSR1P21757 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSR1P21757 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSR1P21757 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSR1P21757 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSR1P21757 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSR1P21757 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSR1P21757 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSR1P21757 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSR1P21757 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSR1P21757 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSR1P21757 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSR1P21757 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSR1P21757 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSR1P21757 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSR1P21757 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSR1P21757 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MSR1P21757 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSR1P21757 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MSR1P21757 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSR1P21757 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSR1P21757 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MSR1P21757 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSR1P21757 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MSR1P21757 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MSR1P21757 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSR1P21757 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSR1P21757 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSR1P21757 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MSR1P21757 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MSR1P21757 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSR1P21757 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSR1P21757 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MSR1P21757 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSR1P21757 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MSR1P21757 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MSR1P21757 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MSR1P21757 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MSR1P21757 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MSR1P21757 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MSR1P21757 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
MSR1P21757 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
MSR1P21757 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSR1P21757 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MSR1P21757 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MSR1P21757 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MSR1P21757 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MSR1P21757 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MSR1P21757 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MSR1P21757 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSR1P21757 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MSR1P21757 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSR1P21757 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSR1P21757 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSR1P21757 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
MSR1P21757 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSR1P21757 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MSR1P21757 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSR1P21757 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MSR1P21757 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSR1P21757 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSR1P21757 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MSR1P21757 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSR1P21757 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSR1P21757 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSR1P21757 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSR1P21757 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSR1P21757 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSR1P21757 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSR1P21757 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSR1P21757 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSR1P21757 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSR1P21757 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSR1P21757 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSR1P21757 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSR1P21757 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSR1P21757 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSR1P21757 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MSR1P21757 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSR1P21757 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSR1P21757 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSR1P21757 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSR1P21757 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSR1P21757 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSR1P21757 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSR1P21757 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSR1P21757 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSR1P21757 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSR1P21757 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSR1P21757 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms