Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms