Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GM2AP17900 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GM2AP17900 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GM2AP17900 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GM2AP17900 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GM2AP17900 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GM2AP17900 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GM2AP17900 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GM2AP17900 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GM2AP17900 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GM2AP17900 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GM2AP17900 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GM2AP17900 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GM2AP17900 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GM2AP17900 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GM2AP17900 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GM2AP17900 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GM2AP17900 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GM2AP17900 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GM2AP17900 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GM2AP17900 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GM2AP17900 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GM2AP17900 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GM2AP17900 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GM2AP17900 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GM2AP17900 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GM2AP17900 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GM2AP17900 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GM2AP17900 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GM2AP17900 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GM2AP17900 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GM2AP17900 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GM2AP17900 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GM2AP17900 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GM2AP17900 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GM2AP17900 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GM2AP17900 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GM2AP17900 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GM2AP17900 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GM2AP17900 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GM2AP17900 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GM2AP17900 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GM2AP17900 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GM2AP17900 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GM2AP17900 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GM2AP17900 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GM2AP17900 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GM2AP17900 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GM2AP17900 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GM2AP17900 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GM2AP17900 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GM2AP17900 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GM2AP17900 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GM2AP17900 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GM2AP17900 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GM2AP17900 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GM2AP17900 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GM2AP17900 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GM2AP17900 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GM2AP17900 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GM2AP17900 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GM2AP17900 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GM2AP17900 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GM2AP17900 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GM2AP17900 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GM2AP17900 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GM2AP17900 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GM2AP17900 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GM2AP17900 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GM2AP17900 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GM2AP17900 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GM2AP17900 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GM2AP17900 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GM2AP17900 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GM2AP17900 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GM2AP17900 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GM2AP17900 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GM2AP17900 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GM2AP17900 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GM2AP17900 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GM2AP17900 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GM2AP17900 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GM2AP17900 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GM2AP17900 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GM2AP17900 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GM2AP17900 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GM2AP17900 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GM2AP17900 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GM2AP17900 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GM2AP17900 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GM2AP17900 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GM2AP17900 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GM2AP17900 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GM2AP17900 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GM2AP17900 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GM2AP17900 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GM2AP17900 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GM2AP17900 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GM2AP17900 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GM2AP17900 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms