Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT10P13645 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT10P13645 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT10P13645 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT10P13645 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT10P13645 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT10P13645 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT10P13645 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT10P13645 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT10P13645 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT10P13645 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT10P13645 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT10P13645 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT10P13645 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT10P13645 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT10P13645 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT10P13645 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT10P13645 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT10P13645 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT10P13645 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT10P13645 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT10P13645 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT10P13645 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT10P13645 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT10P13645 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT10P13645 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT10P13645 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT10P13645 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT10P13645 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT10P13645 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT10P13645 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT10P13645 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT10P13645 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT10P13645 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT10P13645 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT10P13645 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT10P13645 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT10P13645 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT10P13645 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT10P13645 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT10P13645 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT10P13645 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT10P13645 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT10P13645 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT10P13645 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT10P13645 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT10P13645 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT10P13645 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT10P13645 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT10P13645 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT10P13645 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT10P13645 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT10P13645 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT10P13645 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT10P13645 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT10P13645 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT10P13645 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT10P13645 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT10P13645 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT10P13645 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT10P13645 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT10P13645 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT10P13645 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT10P13645 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT10P13645 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT10P13645 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT10P13645 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT10P13645 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT10P13645 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT10P13645 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT10P13645 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT10P13645 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT10P13645 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT10P13645 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT10P13645 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT10P13645 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT10P13645 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT10P13645 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT10P13645 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRT10P13645 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRT10P13645 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KRT10P13645 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRT10P13645 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRT10P13645 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KRT10P13645 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRT10P13645 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRT10P13645 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRT10P13645 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRT10P13645 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRT10P13645 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRT10P13645 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRT10P13645 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRT10P13645 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRT10P13645 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRT10P13645 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRT10P13645 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRT10P13645 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRT10P13645 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRT10P13645 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRT10P13645 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms