Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODC1P11926 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODC1P11926 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODC1P11926 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODC1P11926 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODC1P11926 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODC1P11926 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODC1P11926 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODC1P11926 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODC1P11926 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODC1P11926 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODC1P11926 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODC1P11926 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODC1P11926 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODC1P11926 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODC1P11926 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ODC1P11926 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODC1P11926 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODC1P11926 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODC1P11926 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODC1P11926 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODC1P11926 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODC1P11926 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODC1P11926 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODC1P11926 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODC1P11926 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODC1P11926 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODC1P11926 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODC1P11926 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODC1P11926 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODC1P11926 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODC1P11926 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODC1P11926 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODC1P11926 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODC1P11926 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODC1P11926 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODC1P11926 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODC1P11926 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODC1P11926 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODC1P11926 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODC1P11926 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODC1P11926 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODC1P11926 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODC1P11926 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODC1P11926 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODC1P11926 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODC1P11926 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODC1P11926 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODC1P11926 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ODC1P11926 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODC1P11926 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODC1P11926 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODC1P11926 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODC1P11926 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODC1P11926 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODC1P11926 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODC1P11926 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODC1P11926 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODC1P11926 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODC1P11926 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODC1P11926 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODC1P11926 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODC1P11926 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODC1P11926 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ODC1P11926 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODC1P11926 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODC1P11926 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODC1P11926 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODC1P11926 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODC1P11926 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODC1P11926 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODC1P11926 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODC1P11926 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODC1P11926 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODC1P11926 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODC1P11926 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODC1P11926 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODC1P11926 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODC1P11926 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODC1P11926 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODC1P11926 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODC1P11926 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODC1P11926 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ODC1P11926 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODC1P11926 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODC1P11926 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ODC1P11926 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODC1P11926 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODC1P11926 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ODC1P11926 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODC1P11926 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODC1P11926 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODC1P11926 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODC1P11926 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODC1P11926 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODC1P11926 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODC1P11926 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODC1P11926 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODC1P11926 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ODC1P11926 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms