Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMC1P11047 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms