Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms