Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ85

DUX4L2, Double homeobox protein 4-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L2P0CJ85 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4L2P0CJ85 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4L2P0CJ85 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4L2P0CJ85 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4L2P0CJ85 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4L2P0CJ85 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4L2P0CJ85 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4L2P0CJ85 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4L2P0CJ85 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4L2P0CJ85 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4L2P0CJ85 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4L2P0CJ85 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4L2P0CJ85 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4L2P0CJ85 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4L2P0CJ85 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4L2P0CJ85 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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