Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EGFRP00533 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EGFRP00533 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EGFRP00533 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EGFRP00533 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EGFRP00533 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EGFRP00533 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EGFRP00533 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EGFRP00533 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EGFRP00533 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EGFRP00533 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EGFRP00533 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EGFRP00533 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EGFRP00533 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EGFRP00533 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EGFRP00533 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EGFRP00533 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EGFRP00533 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EGFRP00533 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EGFRP00533 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EGFRP00533 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EGFRP00533 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EGFRP00533 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EGFRP00533 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EGFRP00533 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EGFRP00533 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EGFRP00533 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EGFRP00533 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EGFRP00533 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EGFRP00533 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EGFRP00533 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EGFRP00533 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EGFRP00533 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EGFRP00533 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EGFRP00533 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EGFRP00533 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EGFRP00533 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EGFRP00533 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EGFRP00533 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EGFRP00533 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EGFRP00533 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EGFRP00533 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EGFRP00533 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EGFRP00533 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EGFRP00533 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EGFRP00533 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EGFRP00533 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EGFRP00533 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EGFRP00533 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EGFRP00533 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EGFRP00533 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EGFRP00533 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EGFRP00533 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EGFRP00533 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EGFRP00533 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EGFRP00533 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EGFRP00533 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EGFRP00533 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EGFRP00533 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EGFRP00533 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EGFRP00533 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EGFRP00533 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EGFRP00533 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EGFRP00533 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EGFRP00533 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EGFRP00533 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EGFRP00533 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EGFRP00533 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EGFRP00533 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EGFRP00533 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EGFRP00533 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EGFRP00533 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EGFRP00533 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EGFRP00533 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EGFRP00533 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EGFRP00533 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EGFRP00533 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EGFRP00533 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EGFRP00533 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EGFRP00533 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EGFRP00533 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EGFRP00533 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EGFRP00533 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EGFRP00533 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EGFRP00533 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EGFRP00533 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EGFRP00533 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EGFRP00533 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EGFRP00533 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EGFRP00533 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EGFRP00533 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EGFRP00533 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EGFRP00533 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EGFRP00533 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EGFRP00533 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EGFRP00533 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EGFRP00533 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EGFRP00533 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EGFRP00533 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EGFRP00533 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms