Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCATO75600 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCATO75600 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCATO75600 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCATO75600 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCATO75600 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GCATO75600 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCATO75600 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCATO75600 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCATO75600 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCATO75600 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCATO75600 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCATO75600 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCATO75600 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCATO75600 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCATO75600 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GCATO75600 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCATO75600 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCATO75600 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GCATO75600 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCATO75600 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GCATO75600 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCATO75600 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCATO75600 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCATO75600 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCATO75600 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCATO75600 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCATO75600 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCATO75600 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCATO75600 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCATO75600 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCATO75600 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCATO75600 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCATO75600 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCATO75600 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCATO75600 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCATO75600 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCATO75600 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCATO75600 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCATO75600 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCATO75600 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCATO75600 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCATO75600 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCATO75600 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCATO75600 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCATO75600 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GCATO75600 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCATO75600 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCATO75600 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GCATO75600 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCATO75600 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCATO75600 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCATO75600 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCATO75600 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCATO75600 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GCATO75600 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCATO75600 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCATO75600 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCATO75600 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCATO75600 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCATO75600 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCATO75600 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCATO75600 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCATO75600 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCATO75600 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCATO75600 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCATO75600 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCATO75600 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCATO75600 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCATO75600 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCATO75600 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCATO75600 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCATO75600 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCATO75600 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCATO75600 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCATO75600 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCATO75600 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCATO75600 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCATO75600 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCATO75600 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCATO75600 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCATO75600 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCATO75600 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GCATO75600 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCATO75600 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCATO75600 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCATO75600 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCATO75600 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCATO75600 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCATO75600 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCATO75600 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCATO75600 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCATO75600 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCATO75600 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCATO75600 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCATO75600 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCATO75600 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCATO75600 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCATO75600 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCATO75600 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms