Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms