Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F3O00716 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F3O00716 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F3O00716 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F3O00716 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F3O00716 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F3O00716 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F3O00716 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F3O00716 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F3O00716 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F3O00716 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F3O00716 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F3O00716 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F3O00716 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F3O00716 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F3O00716 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F3O00716 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F3O00716 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F3O00716 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F3O00716 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F3O00716 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F3O00716 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F3O00716 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F3O00716 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F3O00716 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F3O00716 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F3O00716 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F3O00716 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F3O00716 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F3O00716 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F3O00716 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F3O00716 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F3O00716 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F3O00716 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F3O00716 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F3O00716 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F3O00716 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F3O00716 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F3O00716 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F3O00716 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F3O00716 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F3O00716 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F3O00716 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F3O00716 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F3O00716 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F3O00716 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F3O00716 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F3O00716 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F3O00716 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F3O00716 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F3O00716 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F3O00716 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F3O00716 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F3O00716 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F3O00716 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F3O00716 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F3O00716 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F3O00716 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F3O00716 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F3O00716 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F3O00716 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F3O00716 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F3O00716 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F3O00716 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F3O00716 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F3O00716 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F3O00716 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F3O00716 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F3O00716 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F3O00716 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F3O00716 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
E2F3O00716 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
E2F3O00716 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
E2F3O00716 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
E2F3O00716 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
E2F3O00716 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F3O00716 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F3O00716 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F3O00716 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F3O00716 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F3O00716 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F3O00716 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F3O00716 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F3O00716 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F3O00716 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F3O00716 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F3O00716 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F3O00716 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F3O00716 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F3O00716 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F3O00716 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F3O00716 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F3O00716 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F3O00716 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F3O00716 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F3O00716 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F3O00716 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F3O00716 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F3O00716 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F3O00716 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms