Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms