Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N9

USH1C, Harmonin, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USH1CQ9Y6N9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USH1CQ9Y6N9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USH1CQ9Y6N9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USH1CQ9Y6N9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
USH1CQ9Y6N9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
USH1CQ9Y6N9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USH1CQ9Y6N9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USH1CQ9Y6N9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USH1CQ9Y6N9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USH1CQ9Y6N9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USH1CQ9Y6N9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USH1CQ9Y6N9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USH1CQ9Y6N9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USH1CQ9Y6N9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USH1CQ9Y6N9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USH1CQ9Y6N9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USH1CQ9Y6N9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USH1CQ9Y6N9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USH1CQ9Y6N9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USH1CQ9Y6N9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USH1CQ9Y6N9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USH1CQ9Y6N9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USH1CQ9Y6N9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USH1CQ9Y6N9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USH1CQ9Y6N9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USH1CQ9Y6N9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USH1CQ9Y6N9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USH1CQ9Y6N9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
USH1CQ9Y6N9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USH1CQ9Y6N9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USH1CQ9Y6N9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USH1CQ9Y6N9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USH1CQ9Y6N9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USH1CQ9Y6N9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USH1CQ9Y6N9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USH1CQ9Y6N9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USH1CQ9Y6N9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USH1CQ9Y6N9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USH1CQ9Y6N9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USH1CQ9Y6N9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
USH1CQ9Y6N9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USH1CQ9Y6N9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USH1CQ9Y6N9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USH1CQ9Y6N9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
USH1CQ9Y6N9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USH1CQ9Y6N9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
USH1CQ9Y6N9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USH1CQ9Y6N9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USH1CQ9Y6N9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USH1CQ9Y6N9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USH1CQ9Y6N9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USH1CQ9Y6N9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USH1CQ9Y6N9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USH1CQ9Y6N9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USH1CQ9Y6N9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USH1CQ9Y6N9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USH1CQ9Y6N9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USH1CQ9Y6N9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USH1CQ9Y6N9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
USH1CQ9Y6N9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USH1CQ9Y6N9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USH1CQ9Y6N9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USH1CQ9Y6N9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USH1CQ9Y6N9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USH1CQ9Y6N9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
USH1CQ9Y6N9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USH1CQ9Y6N9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USH1CQ9Y6N9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USH1CQ9Y6N9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USH1CQ9Y6N9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USH1CQ9Y6N9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USH1CQ9Y6N9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USH1CQ9Y6N9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USH1CQ9Y6N9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USH1CQ9Y6N9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USH1CQ9Y6N9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USH1CQ9Y6N9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USH1CQ9Y6N9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USH1CQ9Y6N9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USH1CQ9Y6N9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USH1CQ9Y6N9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USH1CQ9Y6N9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USH1CQ9Y6N9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
USH1CQ9Y6N9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USH1CQ9Y6N9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USH1CQ9Y6N9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USH1CQ9Y6N9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USH1CQ9Y6N9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USH1CQ9Y6N9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USH1CQ9Y6N9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USH1CQ9Y6N9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USH1CQ9Y6N9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USH1CQ9Y6N9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USH1CQ9Y6N9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USH1CQ9Y6N9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USH1CQ9Y6N9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USH1CQ9Y6N9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USH1CQ9Y6N9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USH1CQ9Y6N9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USH1CQ9Y6N9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms