Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y696

CLIC4, Chloride intracellular channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC4Q9Y696 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLIC4Q9Y696 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLIC4Q9Y696 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLIC4Q9Y696 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLIC4Q9Y696 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLIC4Q9Y696 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLIC4Q9Y696 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLIC4Q9Y696 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLIC4Q9Y696 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLIC4Q9Y696 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLIC4Q9Y696 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLIC4Q9Y696 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLIC4Q9Y696 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIC4Q9Y696 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIC4Q9Y696 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIC4Q9Y696 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIC4Q9Y696 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIC4Q9Y696 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIC4Q9Y696 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIC4Q9Y696 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIC4Q9Y696 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLIC4Q9Y696 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLIC4Q9Y696 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLIC4Q9Y696 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLIC4Q9Y696 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CLIC4Q9Y696 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CLIC4Q9Y696 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CLIC4Q9Y696 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CLIC4Q9Y696 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CLIC4Q9Y696 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CLIC4Q9Y696 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLIC4Q9Y696 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CLIC4Q9Y696 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CLIC4Q9Y696 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLIC4Q9Y696 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLIC4Q9Y696 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLIC4Q9Y696 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLIC4Q9Y696 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLIC4Q9Y696 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CLIC4Q9Y696 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLIC4Q9Y696 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLIC4Q9Y696 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CLIC4Q9Y696 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLIC4Q9Y696 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CLIC4Q9Y696 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLIC4Q9Y696 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLIC4Q9Y696 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLIC4Q9Y696 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLIC4Q9Y696 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLIC4Q9Y696 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLIC4Q9Y696 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLIC4Q9Y696 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLIC4Q9Y696 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLIC4Q9Y696 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLIC4Q9Y696 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLIC4Q9Y696 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLIC4Q9Y696 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLIC4Q9Y696 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLIC4Q9Y696 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLIC4Q9Y696 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CLIC4Q9Y696 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLIC4Q9Y696 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLIC4Q9Y696 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLIC4Q9Y696 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLIC4Q9Y696 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLIC4Q9Y696 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CLIC4Q9Y696 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CLIC4Q9Y696 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLIC4Q9Y696 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLIC4Q9Y696 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLIC4Q9Y696 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLIC4Q9Y696 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLIC4Q9Y696 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLIC4Q9Y696 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLIC4Q9Y696 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLIC4Q9Y696 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLIC4Q9Y696 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLIC4Q9Y696 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLIC4Q9Y696 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLIC4Q9Y696 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLIC4Q9Y696 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLIC4Q9Y696 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLIC4Q9Y696 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLIC4Q9Y696 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLIC4Q9Y696 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CLIC4Q9Y696 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLIC4Q9Y696 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLIC4Q9Y696 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLIC4Q9Y696 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLIC4Q9Y696 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLIC4Q9Y696 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLIC4Q9Y696 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLIC4Q9Y696 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLIC4Q9Y696 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLIC4Q9Y696 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLIC4Q9Y696 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLIC4Q9Y696 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLIC4Q9Y696 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLIC4Q9Y696 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLIC4Q9Y696 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms