Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RAD54BQ9Y620 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAD54BQ9Y620 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAD54BQ9Y620 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAD54BQ9Y620 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAD54BQ9Y620 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAD54BQ9Y620 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAD54BQ9Y620 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAD54BQ9Y620 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAD54BQ9Y620 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAD54BQ9Y620 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAD54BQ9Y620 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAD54BQ9Y620 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAD54BQ9Y620 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAD54BQ9Y620 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAD54BQ9Y620 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD54BQ9Y620 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD54BQ9Y620 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD54BQ9Y620 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD54BQ9Y620 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAD54BQ9Y620 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAD54BQ9Y620 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAD54BQ9Y620 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAD54BQ9Y620 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAD54BQ9Y620 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAD54BQ9Y620 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAD54BQ9Y620 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RAD54BQ9Y620 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAD54BQ9Y620 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAD54BQ9Y620 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RAD54BQ9Y620 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAD54BQ9Y620 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD54BQ9Y620 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD54BQ9Y620 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD54BQ9Y620 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD54BQ9Y620 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD54BQ9Y620 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD54BQ9Y620 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD54BQ9Y620 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAD54BQ9Y620 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAD54BQ9Y620 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAD54BQ9Y620 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAD54BQ9Y620 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD54BQ9Y620 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD54BQ9Y620 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAD54BQ9Y620 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAD54BQ9Y620 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAD54BQ9Y620 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAD54BQ9Y620 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAD54BQ9Y620 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAD54BQ9Y620 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAD54BQ9Y620 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAD54BQ9Y620 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAD54BQ9Y620 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAD54BQ9Y620 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAD54BQ9Y620 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAD54BQ9Y620 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAD54BQ9Y620 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAD54BQ9Y620 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAD54BQ9Y620 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAD54BQ9Y620 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAD54BQ9Y620 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAD54BQ9Y620 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAD54BQ9Y620 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAD54BQ9Y620 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAD54BQ9Y620 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAD54BQ9Y620 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAD54BQ9Y620 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RAD54BQ9Y620 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RAD54BQ9Y620 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RAD54BQ9Y620 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAD54BQ9Y620 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAD54BQ9Y620 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAD54BQ9Y620 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAD54BQ9Y620 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAD54BQ9Y620 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAD54BQ9Y620 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAD54BQ9Y620 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAD54BQ9Y620 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAD54BQ9Y620 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAD54BQ9Y620 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAD54BQ9Y620 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAD54BQ9Y620 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAD54BQ9Y620 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAD54BQ9Y620 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAD54BQ9Y620 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAD54BQ9Y620 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RAD54BQ9Y620 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAD54BQ9Y620 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAD54BQ9Y620 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAD54BQ9Y620 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAD54BQ9Y620 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAD54BQ9Y620 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAD54BQ9Y620 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAD54BQ9Y620 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RAD54BQ9Y620 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAD54BQ9Y620 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAD54BQ9Y620 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAD54BQ9Y620 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAD54BQ9Y620 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms