Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF12Q9Y4X4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF12Q9Y4X4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF12Q9Y4X4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF12Q9Y4X4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF12Q9Y4X4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF12Q9Y4X4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF12Q9Y4X4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF12Q9Y4X4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF12Q9Y4X4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF12Q9Y4X4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF12Q9Y4X4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF12Q9Y4X4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF12Q9Y4X4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF12Q9Y4X4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF12Q9Y4X4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF12Q9Y4X4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF12Q9Y4X4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF12Q9Y4X4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF12Q9Y4X4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF12Q9Y4X4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF12Q9Y4X4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF12Q9Y4X4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF12Q9Y4X4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF12Q9Y4X4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF12Q9Y4X4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF12Q9Y4X4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF12Q9Y4X4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF12Q9Y4X4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF12Q9Y4X4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF12Q9Y4X4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF12Q9Y4X4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF12Q9Y4X4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF12Q9Y4X4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF12Q9Y4X4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF12Q9Y4X4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF12Q9Y4X4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF12Q9Y4X4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF12Q9Y4X4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF12Q9Y4X4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF12Q9Y4X4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF12Q9Y4X4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF12Q9Y4X4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF12Q9Y4X4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF12Q9Y4X4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF12Q9Y4X4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF12Q9Y4X4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF12Q9Y4X4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF12Q9Y4X4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF12Q9Y4X4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF12Q9Y4X4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF12Q9Y4X4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF12Q9Y4X4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF12Q9Y4X4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF12Q9Y4X4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF12Q9Y4X4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF12Q9Y4X4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF12Q9Y4X4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF12Q9Y4X4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF12Q9Y4X4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF12Q9Y4X4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF12Q9Y4X4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF12Q9Y4X4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF12Q9Y4X4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF12Q9Y4X4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLF12Q9Y4X4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLF12Q9Y4X4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLF12Q9Y4X4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLF12Q9Y4X4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLF12Q9Y4X4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLF12Q9Y4X4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF12Q9Y4X4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms