Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF6Q9Y4K3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF6Q9Y4K3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF6Q9Y4K3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF6Q9Y4K3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF6Q9Y4K3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF6Q9Y4K3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF6Q9Y4K3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF6Q9Y4K3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF6Q9Y4K3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF6Q9Y4K3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF6Q9Y4K3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF6Q9Y4K3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF6Q9Y4K3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF6Q9Y4K3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF6Q9Y4K3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF6Q9Y4K3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF6Q9Y4K3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAF6Q9Y4K3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAF6Q9Y4K3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAF6Q9Y4K3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAF6Q9Y4K3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAF6Q9Y4K3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAF6Q9Y4K3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAF6Q9Y4K3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAF6Q9Y4K3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAF6Q9Y4K3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAF6Q9Y4K3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF6Q9Y4K3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF6Q9Y4K3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF6Q9Y4K3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF6Q9Y4K3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF6Q9Y4K3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF6Q9Y4K3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF6Q9Y4K3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF6Q9Y4K3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF6Q9Y4K3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF6Q9Y4K3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF6Q9Y4K3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF6Q9Y4K3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF6Q9Y4K3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF6Q9Y4K3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF6Q9Y4K3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF6Q9Y4K3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF6Q9Y4K3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF6Q9Y4K3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF6Q9Y4K3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF6Q9Y4K3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAF6Q9Y4K3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAF6Q9Y4K3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAF6Q9Y4K3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAF6Q9Y4K3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAF6Q9Y4K3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF6Q9Y4K3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF6Q9Y4K3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF6Q9Y4K3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF6Q9Y4K3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF6Q9Y4K3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF6Q9Y4K3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF6Q9Y4K3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF6Q9Y4K3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF6Q9Y4K3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF6Q9Y4K3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAF6Q9Y4K3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAF6Q9Y4K3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAF6Q9Y4K3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAF6Q9Y4K3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF6Q9Y4K3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF6Q9Y4K3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF6Q9Y4K3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF6Q9Y4K3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF6Q9Y4K3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF6Q9Y4K3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF6Q9Y4K3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF6Q9Y4K3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF6Q9Y4K3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF6Q9Y4K3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF6Q9Y4K3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF6Q9Y4K3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF6Q9Y4K3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF6Q9Y4K3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF6Q9Y4K3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF6Q9Y4K3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF6Q9Y4K3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF6Q9Y4K3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF6Q9Y4K3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF6Q9Y4K3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF6Q9Y4K3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF6Q9Y4K3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAF6Q9Y4K3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAF6Q9Y4K3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAF6Q9Y4K3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAF6Q9Y4K3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF6Q9Y4K3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF6Q9Y4K3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF6Q9Y4K3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF6Q9Y4K3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF6Q9Y4K3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF6Q9Y4K3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms