Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHTOPQ9Y3Y2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHTOPQ9Y3Y2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHTOPQ9Y3Y2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHTOPQ9Y3Y2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHTOPQ9Y3Y2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHTOPQ9Y3Y2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHTOPQ9Y3Y2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHTOPQ9Y3Y2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHTOPQ9Y3Y2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHTOPQ9Y3Y2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHTOPQ9Y3Y2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHTOPQ9Y3Y2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHTOPQ9Y3Y2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHTOPQ9Y3Y2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHTOPQ9Y3Y2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHTOPQ9Y3Y2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHTOPQ9Y3Y2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHTOPQ9Y3Y2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHTOPQ9Y3Y2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHTOPQ9Y3Y2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHTOPQ9Y3Y2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHTOPQ9Y3Y2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHTOPQ9Y3Y2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHTOPQ9Y3Y2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHTOPQ9Y3Y2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CHTOPQ9Y3Y2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHTOPQ9Y3Y2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHTOPQ9Y3Y2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHTOPQ9Y3Y2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CHTOPQ9Y3Y2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHTOPQ9Y3Y2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CHTOPQ9Y3Y2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHTOPQ9Y3Y2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CHTOPQ9Y3Y2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHTOPQ9Y3Y2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHTOPQ9Y3Y2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHTOPQ9Y3Y2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHTOPQ9Y3Y2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHTOPQ9Y3Y2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHTOPQ9Y3Y2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHTOPQ9Y3Y2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CHTOPQ9Y3Y2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHTOPQ9Y3Y2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHTOPQ9Y3Y2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHTOPQ9Y3Y2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHTOPQ9Y3Y2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHTOPQ9Y3Y2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHTOPQ9Y3Y2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHTOPQ9Y3Y2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHTOPQ9Y3Y2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHTOPQ9Y3Y2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHTOPQ9Y3Y2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHTOPQ9Y3Y2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHTOPQ9Y3Y2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHTOPQ9Y3Y2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHTOPQ9Y3Y2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHTOPQ9Y3Y2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHTOPQ9Y3Y2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHTOPQ9Y3Y2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHTOPQ9Y3Y2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHTOPQ9Y3Y2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHTOPQ9Y3Y2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHTOPQ9Y3Y2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CHTOPQ9Y3Y2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHTOPQ9Y3Y2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHTOPQ9Y3Y2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHTOPQ9Y3Y2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHTOPQ9Y3Y2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHTOPQ9Y3Y2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHTOPQ9Y3Y2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHTOPQ9Y3Y2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHTOPQ9Y3Y2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHTOPQ9Y3Y2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHTOPQ9Y3Y2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHTOPQ9Y3Y2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHTOPQ9Y3Y2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHTOPQ9Y3Y2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHTOPQ9Y3Y2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHTOPQ9Y3Y2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHTOPQ9Y3Y2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHTOPQ9Y3Y2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHTOPQ9Y3Y2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CHTOPQ9Y3Y2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHTOPQ9Y3Y2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHTOPQ9Y3Y2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHTOPQ9Y3Y2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHTOPQ9Y3Y2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHTOPQ9Y3Y2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms