Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3R0

GRIP1, Glutamate receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIP1Q9Y3R0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIP1Q9Y3R0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIP1Q9Y3R0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIP1Q9Y3R0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIP1Q9Y3R0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIP1Q9Y3R0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIP1Q9Y3R0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GRIP1Q9Y3R0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIP1Q9Y3R0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIP1Q9Y3R0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIP1Q9Y3R0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIP1Q9Y3R0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIP1Q9Y3R0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIP1Q9Y3R0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIP1Q9Y3R0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIP1Q9Y3R0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIP1Q9Y3R0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIP1Q9Y3R0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIP1Q9Y3R0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIP1Q9Y3R0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIP1Q9Y3R0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIP1Q9Y3R0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIP1Q9Y3R0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIP1Q9Y3R0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIP1Q9Y3R0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIP1Q9Y3R0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIP1Q9Y3R0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIP1Q9Y3R0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIP1Q9Y3R0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIP1Q9Y3R0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIP1Q9Y3R0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIP1Q9Y3R0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIP1Q9Y3R0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIP1Q9Y3R0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIP1Q9Y3R0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIP1Q9Y3R0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIP1Q9Y3R0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIP1Q9Y3R0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIP1Q9Y3R0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIP1Q9Y3R0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIP1Q9Y3R0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIP1Q9Y3R0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIP1Q9Y3R0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIP1Q9Y3R0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIP1Q9Y3R0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIP1Q9Y3R0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIP1Q9Y3R0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIP1Q9Y3R0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIP1Q9Y3R0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIP1Q9Y3R0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIP1Q9Y3R0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIP1Q9Y3R0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIP1Q9Y3R0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms